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Yahoo!はOSとしてFreeBSDを採用し,PHPやMySQL自体の開発者が在籍していることで有名です。Yahoo!のMichael J. Radwin氏は下記URLにてカンファレンスでの発表資料を公開しており,そこにはYahoo!の開発環境が詳しく紹介されています。Apacheは1.3ベースで独自チューニングを施している,PHPは独自Extensionをたくさん開発しているなどのほか,一般に参考になる情報も多くあります。
URL:http://public.yahoo.com/~radwin/