第527回ではRStudioのインストール方法を，第529回ではDockerを使ったRStudio Serverについて紹介しました。今回はより便利にDockerイメージを使えるよう，カスタマイズする方法を紹介しましょう。

TinyTeXで日本語PDFを生成できるようにする

第529回でも紹介しているように，Rocker版のRStudio ServerではTeXの実行環境としてRStudioの開発者が作成したTinyTeXを採用しています。

これは一般的なLinuxで使われているTeX Liveではパッケージサイズが大きくなりがちで，結果としてDockerイメージのサイズも大きくなってしまうためです。TeX Liveベースで作られたTinyTeXはTeX Liveのうち最低限必要なものをコンテナイメージに取り込んでおき，残りは必要に応じてtlmgrコマンドでインストールする仕組みになっています。またRの実行環境からtlmgrコマンドを実行できる，tinytexライブラリーも同梱されています。

第529回同様，rocker/verseイメージを起動してみましょう。

$ sudo docker run --rm -d -p 8787:8787 --name verse rocker/verse

メニューからR Markdownファイルを作成し，PDFを選択，「⁠output: pdf_document」の部分を次のように変更します。

output:
  pdf_document:
    latex_engine: lualatex
documentclass: ltjsbook

この状態でKnitを実行すると（Ctrl+Shift+Kを押すと⁠）⁠，pandocがRmdファイルをTeXファイルに変換し，lualatexがPDFを生成しようとします。しかしながらdocumentclassで指定したクラスファイル「ltjsbook.cls」が見つからないために，luatexjaパッケージのインストールを試みます。

実際，R Markdownのプリアンブルに「latex_engine」として「lualatex」を記述した上でPDFを生成しようとすると，いろいろなTeXパッケージをインストールしようとします。documentclassに「ltjsbook」を書いておくと，ltjsbook.clsファイルを提供しているluatexjaパッケージのダウンロードを試みます。

tlmgr search --file --global '/ltjsbook.cls'
Trying to automatically install missing LaTeX packages...
tlmgr install luatexja
（中略）
tlmgr install luatexja
tlmgr install: package already present: luatexja
tlmgr path add
tlmgr search --file --global '/ltjsbook.cls'
! LaTeX Error: File `ltjsbook.cls' not found.

しかしながら，この方法ではなぜかうまくいきません。どうもインストールしたファイルの検索パスがらみの問題のようですが，Dockerイメージの権限が原因かもしれません。あらかじめ必要なパッケージがわかっている場合は，手動でインストールしたほうが良さそうです。

TinyTexにはR向けのtinytexライブラリーがあります。これを使えば，Rコマンドからtlmgrを実行できます。

> tinytex::tlmgr_search('/ltjsbook.cls')
tlmgr search --file --global '/ltjsbook.cls'
luatexja:
    texmf-dist/tex/luatex/luatexja/ltjsbook.cls

> tinytex::tlmgr_install('luatexja')
（中略）
copy /opt/TinyTeX/tlpkg/texlive.tlpdb.tmp to
/opt/TinyTeX/tlpkg/texlive.tlpdb failed:
Operation not permitted at
/opt/TinyTeX/tlpkg/TeXLive/TLPDB.pm line 628.
tlmgr path add

今度は「Operation not permitted」エラーが出てしまいました。rockerイメージのrstudioアカウントはプライマリグループはrstudioであり，サブグループとしてstaffグループに属しています。また，/opt/TinyTex以下の所有者はrootになっているものの，グループはstaffになっています。よってrstudioアカウントでも，/opt/TinyTex以下を変更できるのです。

しかしながらプライマリグループはrstudioであるため，Rコンソールから作成したファイル「/opt/TinyTeX/tlpkg/texlive.tlpdb.tmp」のグループはrstudioになってしまいます。グループの変更を伴うコピーが「Operation not permitted」と言われているようです（※1⁠）⁠。

※1

このあたり不具合というよりは，使い方の問題のような気もしています。

さてRコンソールからのTeXパッケージのインストールはうまくいきませんでした。そこで泥臭い方法ではありますが，とりあえずはDockerのコンテナに入ってインストールしてしまいましょう。コンテナ起動時「--name verse」でコンテナに名前を付けておいたので，以下のようにコンテナ上で直接tlmgrを実行できます。

$ sudo docker exec -it verse tlmgr install luatexja \
  luatexbase ctablestack adobemapping ms filehook
running mktexlsr ...
done running mktexlsr.
tlmgr: package log updated: /opt/TinyTeX/texmf-var/web2c/tlmgr.log

luatexjaの依存関係から最低限必要なパッケージも列挙しています。

また日本語フォントもRockerイメージにはインストールされていませんので，それも合わせてインストールしておきます。

$ sudo docker exec -it verse apt update
$ sudo docker exec -it verse apt install fonts-ipaexfont

あとはKnitを実行すれば，無事に日本語PDFを生成できるはずです。