第1章　海洋島の生物相と進化の法則

• 1-1　大陸島と海洋島
• 1-2　ホットスポットと島弧活動
• 1-3　海洋島の一生
• 1-4　島への移動（3つのW）
• 1-5　定着の困難さ
• 1-6　そもそも進化とは
• 1-7　島の生物進化を促進する要因
• 1-8　種数―面積関係
• 1-9　切れ味鋭い動的平衡説
• 1-10　有用なニッチ理論
• 1-11　遺伝子から進化をみる分子時計
• 1-12　海洋島に共通する島症候群

第2章　小笠原諸島の歴史と生物の由来

• 2-1　小笠原の位置：北南西からの視点
• 2-2　小笠原の範囲：広大な海域に点在する島々
• 2-3　常夏でない気候
• 2-4　植物からみた季節性：フェノロジー
• 2-5　島弧の形成（島の土台作り）
• 2-6　北上する小笠原
• 2-7　氷期の海面低下
• 2-8　3方向からの生物由来
• 2-9　歴史の浅い火山列島の生物相
• 2-10　人と自然の関わりの歴史

第3章　小笠原諸島のユニークな生物たち

• 3-1　非調和な小笠原の生物相
• 3-2　唯一の哺乳類：オガサワラオオコウモリ
• 3-3　絶滅に瀕する大型の陸鳥：オガサワラノスリとアカガシラカラスバト
• 3-4　物怖じしない小鳥たち：メグロウグイスメジロ
• 3-5　豪快な海鳥：アホウドリとカツオドリ
• 3-6　ヘビのいない爬虫類：オガサワラトカゲ
• 3-7　昆虫類の多様な進化と生存の危機
• 3-8　花と昆虫のパートナーシップ（共進化）
• 3-9　進化のショーウィンドウ：陸産貝類
• 3-10　巨木の多い湿性高木林の植物
• 3-11　固有性の高い乾性低木林の植物
• 3-12　植物の適応放散的種分化
• 3-13　巨大小笠原島仮説
• 3-14　目立たない花と性の分化
• 3-15　海水に溺れる種子：固有ハイビスカス
• 3-16　草が木に進化する（草本の木本化現象）
• 3-17　絶滅危惧種の代表：ムニンノボタンとムニンツツジ
• 3-18　海の観光の目玉：クジラとイルカ
• 3-19　アオウミガメの保護増殖
• 3-20　海の中も海洋島
• 3-21　海域から淡水域への進化
• 3-22「東洋のガラパゴス」の意味

第4章　脆弱な島への生物の侵入と保護

• 4-1　恐れ知らずの動物たち
• 4-2　防御機構をもたぬ植物（武装しない植物）
• 4-3　生態系を破壊するノヤギ
• 4-4　昆虫を食べ尽すグリーンアノール
• 4-5　陸産貝類を捕食するプラナリア
• 4-6　空ニッチに収まったリュウキュウマツ
• 4-7　裸地を覆い尽くすギンネム
• 4-8　在来種を駆逐するアカギ
• 4-9　“絞殺し植物”ガジュマルの脅威
• 4-10　先駆的なクマネズミ駆除
• 4-11　危機的な固有種の現状
• 4-12　絶滅危惧種を守る制度
• 4-13　生物多様性の観点から
• 4-14　植栽と遺伝子撹乱
• 4-15　ヤギネコフェンス（万里の長城）の設置

第5章　世界遺産申請とこれからの小笠原

• 5-1　世界遺産に向けて
• 5-2　3つのクライテリア
• 5-3　エコツーリズムの導入
• 5-4　森林生態系保護地域の設定と新ルール

• 地図
• 父島の主な山，地名，遊歩道
• 母島の主な山，地名，遊歩道